Высшим органом управления Международного Третейского суда при Торгово-промышленной палате Кыргызской Республики (далее МТС ТПП) является Наблюдательный совет, который состоит из числа представителей донорских организаций, финансирующих деятельность МТС ТПП, ассоциаций, объединений предпринимателей, профессиональных объединений юристов и др. Наблюдательный совет МТС ТПП утверждает все внутренние документы суда: положение, регламент, список арбитров, устанавливает порядок исчисления арбитражного сбора, ставки гонораров арбитров и других расходов третейского суда, осуществляет контроль и руководство за деятельностью третейского суда. Деятельность МТС ТПП осуществляет Председатель, Заместитель Председателя и Ответственный секретарь.